沉香气味芳香，性辛，微温，无毒，具有行气镇痛、温中止呕、纳气平喘等功效，常用于治疗气逆胸满、喘急心绞痛、积痞、胃寒呕吐、霍乱、男子精冷、恶气恶疮等症。
中医典籍的相关记述也甚多，如《本草备要》谓之“能下气而坠痰涎，能降亦能升，气香入脾，故能理诸气而调中，其色黑。体阳，故人右臂命门，暖精助阳，行气不伤气，温中不助火。”《大明本草》谓之“调中补五脏，益精壮阳，暖腰膝，止转筋吐泻冷气”；《本草纲目》谓之能“冶上热下寒，气逆喘急，大肠虚闭，小便气淋、男子精冷。”
从中医的角度来说，焚香当属外治法中的“气味疗法”。沉香块不起明火。慢慢燃烧会变黑炭化，熏出的袅袅白烟香气四溢，利用燃烧发出的气味，可以免疫辟邪、杀菌消毒、醒神益智、养生保健，据说还有防蚊虫、防潮等功效，因此备受人们青睐。过去人们流行用熏烧沉香来辟邪、除秽、驱鬼，其实就是这个道理。
另外，沉香还被加工成传统中药饮片，如：沉香粉、沉香饮片、沉香曲等。当今，以沉香为原料组方配伍的中成药已有160多种，如沉香化滞丸、沉香养胃丸、沉香化气丸、八味沉香片等。
